《暗花》讲述了腐败警察阿琛和杀手耀东之间的博弈。阿琛被幕后黑手洪先生操控，成为替罪羊，他决定奋起反抗。耀东受雇于洪先生要置阿琛于死地，却对其产生了惺惺相惜之感。阿琛和耀东同归于尽，洪先生的计划也被挫败。

在澳门，两大帮派洪兴帮和义英帮为争夺赌场利益火拼数日未分胜负，洪兴帮老大洪先生此时已病入膏肓，他决定从帮会中选出一个新的老大来掌管大局，他派得力助手乔治（任达华饰）去澳门物色合适的人选，乔治找到了洪兴帮的头号杀手阿深（梁朝伟饰），希望他能够帮助自己的老大争夺这个位置。

阿深是一个非常聪明和冷静的人，他知道这个任务的危险性，但他也知道这是一个难得的机会，他决定接受乔治的邀请，前往澳门参加这场江湖暗战。

义英帮也在为争夺赌场利益而忙碌着，他们的老大基哥（林雪饰）和他的得力助手阿凤（邵美琪饰）也在寻找一个能够帮助他们赢得这场战争的人，他们找到了一个名叫耀东（刘青云饰）的神秘人物，他看起来似乎有着超凡的能力和智慧。

阿深和耀东在澳门相遇了，他们开始了一场惊心动魄的较量，两人都是非常出色的杀手，他们之间的战斗异常激烈，在这场战斗中，阿深逐渐发现了一些不寻常的事情，他开始怀疑自己的任务背后是否隐藏着更大的阴谋。

随着剧情的发展，阿深和耀东的关系变得越来越复杂，他们开始互相了解对方的过去和内心世界，同时也开始对彼此产生了敬意和钦佩，他们之间的友谊并没有持续太久，因为他们最终还是走上了不同的道路。

在这场江湖暗战中，每个人都有自己的目的和动机，洪兴帮、义英帮、阿深、耀东、乔治、阿凤等人都在为自己的利益而奋斗，他们之间的关系错综复杂，充满了背叛和欺骗，这场江湖暗战以一场血腥的屠杀收场，只有少数人幸存下来。

谁是真正的赢家呢？这场江湖暗战到底是为了什么？这些问题一直困扰着观众，直到最后一刻才得到解答。